Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PARP4Q9UKK3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PARP4Q9UKK3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms