Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC5Q9UII4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC5Q9UII4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms