Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFIP11Q9UBB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFIP11Q9UBB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms