Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms