Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HMG20BQ9P0W2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMG20BQ9P0W2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms