Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GGA3Q9NZ52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms