Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM30AQ9NV96 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM30AQ9NV96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms