Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCF3Q9NUQ8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCF3Q9NUQ8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms