Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FARSBQ9NSD9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FARSBQ9NSD9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms