Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLR8Q9NR97 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR8Q9NR97 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR8Q9NR97 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms