Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ASCL3Q9NQ33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms