Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XAB2Q9HCS7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms