Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF2Q9HAK2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms