Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
REEP4Q9H6H4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
REEP4Q9H6H4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms