Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDCBP2Q9H190 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDCBP2Q9H190 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms