Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
REXO4Q9GZR2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms