Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUF2Q9BZD4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUF2Q9BZD4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUF2Q9BZD4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms