Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TBC1D2Q9BYX2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TBC1D2Q9BYX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms