Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SHANK3Q9BYB0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHANK3Q9BYB0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK3Q9BYB0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SHANK3Q9BYB0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK3Q9BYB0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK3Q9BYB0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms