Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECSITQ9BQ95 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECSITQ9BQ95 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms