Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN18Q99952 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPN18Q99952 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms