Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS3Q99687 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MEIS3Q99687 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3Q99687 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3Q99687 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3Q99687 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3Q99687 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3Q99687 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3Q99687 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS3Q99687 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms