Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCF12Q99081 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms