Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SIN3AQ96ST3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SIN3AQ96ST3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms