Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP2Q96SN8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms