Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85AQ96PX6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms