Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSPG4P5Q96PW8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSPG4P5Q96PW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSPG4P5Q96PW8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms