Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF396Q96N95 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF396Q96N95 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms