Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC45A3Q96JT2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms