Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP3Q96FM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP3Q96FM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms