Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ELP4Q96EB1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP4Q96EB1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ELP4Q96EB1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms