Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
OPTNQ96CV9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
OPTNQ96CV9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OPTNQ96CV9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms