Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms