Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF653Q96CK0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms