Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DHX58Q96C10 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms