Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF428Q96B54 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF428Q96B54 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms