Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms