Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD1Q8NHV4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD1Q8NHV4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms