Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHDC9Q8NEP7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHDC9Q8NEP7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC9Q8NEP7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms