Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPFIBP2Q8ND30 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms