Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOF1Q8ND07 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBOF1Q8ND07 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms