Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZIC4Q8N9L1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZIC4Q8N9L1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC4Q8N9L1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC4Q8N9L1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC4Q8N9L1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC4Q8N9L1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ZIC4Q8N9L1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms