Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC155Q8N6L0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms