Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMYD4Q8IYR2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMYD4Q8IYR2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms