Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCA5Q86VQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms