Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PREX2Q70Z35 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PREX2Q70Z35 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PREX2Q70Z35 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms