Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms