Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Asic3Q6X1Y6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Asic3Q6X1Y6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms