Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54Q6NXT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54Q6NXT1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms