Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZKSCAN2Q63HK3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN2Q63HK3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms